在中国，根据《中华人民共和国道路交通安全法》及其相关实施条例的规定，闯红灯是一种严重的交通违法行为，会对驾驶人的驾驶证记分和处以罚款。对于连续闯红灯两次的情况，理论上是可以分开处理的，因为每次闯红灯都是一个独立的违法行为。

根据《中华人民共和国道路交通安全法》第九十条规定，机动车驾驶人违反道路交通安全法律、法规关于道路通行规定的，处警告或者二十元以上二百元以下罚款。同时，根据该法第一百零七条的规定，公安机关交通管理部门可以对违法行为人进行记分处理。

具体到闯红灯的行为，根据《道路交通安全违法行为处理程序规定》第十三条，对于闯红灯的违法行为，公安机关交通管理部门可以对驾驶人处以二百元罚款，并记6分。因此，如果一名驾驶人在短时间内连续两次闯红灯，他将会被累计处以四百元罚款，并记12分。

在实际操作中，可能会遇到以下几个问题：

1. 如果连续闯红灯的行为发生在很短的时间内，是否可以合并处理？ 虽然每次闯红灯都可以作为单独的违法行为进行处理，但如果这些行为发生在非常接近的时间内，公安机关交通管理部门可能会将其视为一次性违法行为的处理，但这并不意味着处罚会减轻，而是指在处理程序上可能会更加集中。

2. 如果驾驶人在第一次闯红灯后立即停车，但随后又闯了第二次红灯，这种情况如何处理？ 无论驾驶人在第一次闯红灯后是否停车，每次闯红灯都是一个独立的违法行为。因此，即使驾驶人在第一次闯红灯后停车，随后的第二次闯红灯仍然会被作为另一个独立的行为进行处理。

3. 如果驾驶人在连续闯红灯后主动投案自首，是否可以从轻或减轻处罚？ 根据《中华人民共和国道路交通安全法》的规定，主动投案自首并不是从轻或减轻处罚的理由。但是，驾驶人主动承认错误的态度可能会在一定程度上影响执法部门对其违法行为的主观评价，但这并不意味着处罚本身会有实质性的减轻。

综上所述，连续闯红灯两次可以分开处理，每次闯红灯都会被视为独立的违法行为，并相应地进行罚款和记分。驾驶人在遇到此类情况时，应当严格遵守交通法规，避免违法行为的发生，以确保自身和他人的安全。同时，对于已经发生的违法行为，应当依法接受处罚，并通过合法途径维护自己的权益。