入股了退股本金可以拿回吗，起诉时被告公司已注销？入股后退股能否拿回本金取决于公司章程和法律规定，起诉已注销公司需依法确定责任主体。

在中国，股东入股后退股能否拿回本金主要依据《公司法》和公司章程的规定。根据《公司法》第七十四条，股东在特定情况下有权请求公司收购其股权，如公司连续五年不分红且符合分红条件，或者公司合并、分立、转让主要财产等。此外，公司章程可能对股东退股有特别约定，这些约定通常优先于法律规定。因此，股东在考虑退股时应首先查阅公司章程，了解是否有关于退股的明确规定。

如果股东在起诉时发现被告公司已经注销，需要根据《公司法》和相关司法解释确定责任主体。根据《公司法》第一百八十九条，公司注销后，其法人资格终止，但其债务并未随之消失。债权人可以向公司的清算组成员、股东或者其他责任人追偿。《最高人民法院关于适用〈中华人民共和国公司法〉若干问题的规定》第二十一条也明确了在公司注销后，债权人可以向清算组成员主张权利。

具体操作步骤如下：

1. 确定责任主体：根据公司注销时的清算报告和相关法律规定，确定应承担责任的主体，可能是清算组成员、股东或其他责任人。
2. 收集证据：收集与案件相关的所有证据，包括合同、交易记录、公司注销文件等。
3. 提起诉讼：向法院提起诉讼，明确指出责任主体及其应承担的责任。
4. 等待法院判决：法院将根据提交的证据和法律规定作出判决。

文章结尾拓展问题：

1. 股东在公司注销后如何保护自己的权益？ 股东应在公司注销前积极参与清算过程，确保自己的权益得到妥善处理。同时，了解并利用《公司法》等相关法律规定的权利，如知情权、分红权等，也是重要的保护手段。

2. 公司注销后，股东的责任是否解除？ 一般情况下，公司注销后，股东的个人责任随公司法人资格的终止而终止。但如果存在未清偿的债务，股东可能需要根据其在公司中的责任比例承担相应责任。具体情况需根据法律规定和实际情况判断。