在提起离婚诉讼后，如果双方当事人经过协商决定以协议的方式结束婚姻关系，可以按照以下步骤办理协议离婚：

　　1. 准备材料：首先，双方需要准备好相关的个人身份证明文件，如身份证、户口簿等。此外，还需要准备好结婚证原件，以及双方共同签署的离婚协议书。离婚协议书应当明确双方关于财产分割、子女抚养、债务处理等方面的具体约定。

　　2. 填写离婚登记申请书：双方当事人需要亲自到婚姻登记机关，填写《离婚登记申请书》。在申请书中，应当注明双方自愿离婚的意向，以及对离婚协议内容的共同认可。

　　3. 提交材料：将准备好的个人身份证明文件、结婚证原件、离婚协议书以及填写好的《离婚登记申请书》一并提交给婚姻登记机关。

　　4. 审查与受理：婚姻登记机关将对提交的材料进行审查，确保所有文件齐全、真实有效，并且符合法律规定。如果材料符合要求，婚姻登记机关将予以受理。

　　5. 领取离婚证：在材料审查通过后，双方当事人可以在规定的时间内到婚姻登记机关领取离婚证。离婚证是证明双方已经依法解除婚姻关系的法定凭证。

　　6. 办理其他相关手续：根据离婚协议的内容，双方可能需要进一步办理财产分割、子女抚养权转移等相关手续。这些手续可能涉及房产过户、银行账户变更、子女入学安排等方面。

　　7. 法律咨询与支持：在整个协议离婚的过程中，如果遇到任何法律问题或纠纷，双方可以寻求专业律师的帮助，以确保权益得到妥善保护。

　　通过以上步骤，双方当事人可以在提起离婚诉讼后，通过协议的方式顺利办理离婚手续，合法、和平地解除婚姻关系。