知识产权诉讼时效过后，权利人原则上不能再通过诉讼程序请求法院判令侵权人停止侵权行为、赔偿损失等。根据《中华人民共和国民法典》第一百八十八条的规定，向人民法院请求保护民事权利的诉讼时效期间为三年，自权利人知道或者应当知道权利受到损害以及义务人之日起计算。但是，即使诉讼时效期间届满，权利人仍有可能通过其他方式主张权利，例如协商解决、调解等。

在诉讼时效过后，权利人主张侵权的条件和赔偿规则如下：

1. 侵权行为继续存在：如果侵权行为在诉讼时效期间届满后仍在继续，权利人可以要求侵权人停止侵权行为。根据《民法典》第一百九十六条的规定，因侵权行为持续发生的损害赔偿请求权，不受诉讼时效期间的限制。

2. 自愿履行：即使诉讼时效期间届满，侵权人自愿履行义务的，权利人可以接受。根据《民法典》第一百九十二条的规定，诉讼时效期间届满后，义务人可以对权利人履行义务，权利人不得请求履行。

3. 赔偿规则：在诉讼时效过后，如果侵权人自愿赔偿，赔偿金额通常由双方协商确定。如果侵权行为持续存在，权利人请求赔偿时，赔偿金额应当根据侵权行为的持续时间、侵权行为的性质、侵权后果等因素综合确定。

在处理知识产权诉讼时效过后的问题时，可能会遇到以下问题及相关法律条款：

• 诉讼时效中断：根据《民法典》第一百九十五条的规定，诉讼时效因提起诉讼、请求或者承认债务而中断。中断后，已进行的时效期间不计入新的时效期间。

• 诉讼时效中止：根据《民法典》第一百九十四条的规定，诉讼时效因不可抗力或者其他障碍不能行使请求权的，诉讼时效中止。自中止时效的原因消除之日起满六个月，诉讼时效期间届满。

• 诉讼时效的延长：在特殊情况下，如果权利人因客观原因不能在诉讼时效期间内行使请求权，可以根据《民法典》第一百八十九条的规定，向人民法院申请延长诉讼时效期间。

综上所述，知识产权诉讼时效过后，权利人通过诉讼途径主张侵权和请求赔偿的权利通常会受到限制。但在特定情况下，如侵权行为持续存在，权利人仍有可能通过非诉讼途径主张权利。此外，侵权人自愿履行义务时，权利人可以接受赔偿。在处理此类问题时，应当根据具体情况和法律规定，合理选择维权途径。同时，权利人应当注意诉讼时效的问题，及时采取法律行动，以免错过诉讼时效，导致无法通过法律途径维护自己的合法权益。