知识产权案件的律师费收费方式通常有以下几种：

1. 按小时收费：律师按照工作时间计费，每小时的费用根据律师的经验、专业水平和所在地区的市场行情而定。这种方式适用于案件复杂、工作量不确定的情况。

2. 固定费用：律师与客户事先商定一个固定的总费用，不论案件最终耗费多少时间和精力，律师费都是固定的。这种方式适用于案件相对简单、工作量可预估的情况。

3. 成功费用：律师费的支付与案件的结果挂钩，如果案件胜诉或达成有利和解，律师可以获得额外的成功费用。这种方式在知识产权侵权案件中较为常见。

4. 风险代理费：律师与客户约定，如果案件胜诉，律师可以获得一定比例的赔偿金额作为律师费；如果败诉，则律师可能只收取较低的费用或者不收费。这种方式适用于客户资金紧张，希望减轻前期经济压力的情况。

在中国，律师费的收费标准和方式没有明确的法律规定，主要由律师与客户之间的协议来决定。但是，律师收费应当遵循公平、合理的原则，不得违反《中华人民共和国律师法》和《律师收费办法》的相关规定。根据《律师法》第三十七条规定，律师收费应当遵循公开、公正、合理的原则，不得收取不正当费用。

在知识产权案件中，律师费的收费还可能受到案件类型的影响。例如，在商标、专利、著作权等不同类型的知识产权案件中，律师的工作内容和工作量可能会有所不同，因此收费方式和金额也会有所区别。

在处理知识产权案件时，律师和客户可能会遇到以下问题：

1. 律师费预算不足：客户可能因为缺乏经验或预算有限而难以支付高额的律师费。在这种情况下，律师可以建议客户选择适合其经济状况的收费方式，或者寻求法律援助。

2. 律师费争议：如果客户对律师的收费有异议，可以要求律师提供详细的费用清单，并与律师协商解决。如果协商不成，可以向律师协会投诉或向法院提起诉讼。

3. 跨国案件的律师费：在处理跨国知识产权案件时，律师费的计算可能涉及不同国家的货币和法律体系。在这种情况下，律师和客户需要在合同中明确约定汇率转换、税务处理等细节。

总之，知识产权案件的律师费收费方式多样，律师和客户应根据案件的具体情况和双方的经济状况，通过协商确定合适的收费方式。在整个过程中，律师应保持透明、公正的态度，确保律师费的合理性和合法性。