恶意提起专利侵权诉讼是指当事人在没有合理依据的情况下，故意提起专利侵权诉讼，意图损害对方合法权益或者扰乱正常市场秩序的行为。在中国，对于恶意提起专利侵权诉讼的处理，主要依据《中华人民共和国民事诉讼法》、《中华人民共和国专利法》以及《最高人民法院关于审理专利纠纷案件适用法律问题的若干规定》等相关法律法规。

1. 《中华人民共和国民事诉讼法》第十三条第一款规定，当事人有权依法自由行使诉讼权利，但不得滥用诉讼权利损害国家利益、社会公共利益或者他人合法权益。

2. 《中华人民共和国专利法》第六十五条规定，专利权人或者其他利害关系人认为他人侵犯其专利权的，可以向人民法院提起诉讼。但是，如果诉讼被认定为恶意提起，可能会受到法律的制裁。

3. 《最高人民法院关于审理专利纠纷案件适用法律问题的若干规定》第二条规定，当事人提起专利侵权诉讼，应当提交证据证明其享有专利权，并且被告实施了侵犯其专利权的行为。如果没有充分证据支持其主张，可能会被认为是恶意诉讼。

对于恶意提起专利侵权诉讼的处理，可以采取以下措施：

• 驳回诉讼请求：如果法院认定原告提起的专利侵权诉讼属于恶意诉讼，可以依法驳回其诉讼请求。

• 追究法律责任：根据《民事诉讼法》第一百一十一条规定，当事人滥用诉讼权利，妨害民事诉讼正常进行的，人民法院可以对其进行训诫，责令其改正；情节严重的，可以处以罚款或者拘留。

• 赔偿损失：如果恶意诉讼给被告造成了损失，被告可以根据《民法典》第一百八十三条的规定，要求原告赔偿因恶意诉讼所遭受的损失，包括合理的律师费用、误工费等。

在处理恶意提起专利侵权诉讼的问题时，可能会遇到以下问题：

1. 如何界定“恶意”：恶意通常指的是明知无理或者故意忽视事实真相提起诉讼。法院在判断是否为恶意诉讼时，会综合考虑原告提起诉讼的动机、证据的充分性、诉讼过程中的行为等因素。

2. 如何证明恶意诉讼：被告需要提供证据证明原告的诉讼行为是恶意的，这可能包括原告明知其专利无效或者不具有侵权事实，仍然故意提起诉讼的证据。

3. 如何防止恶意诉讼：企业可以通过加强专利管理，确保自己的专利有效性和稳定性，同时在面对专利侵权诉讼时，积极应诉，提供充分的抗辩理由和证据，以防止被恶意诉讼所困扰。

4. 如何处理跨地区的恶意诉讼：如果恶意诉讼涉及跨地区的专利纠纷，可以根据《民事诉讼法》第二十八条的规定，选择被告住所地、合同履行地、侵权行为地等地的人民法院管辖。

综上所述，恶意提起专利侵权诉讼是一种滥用诉讼权利的行为，应当受到法律的制裁。当事人应当依法行使诉讼权利，避免滥用诉讼权利损害他人合法权益或扰乱市场秩序。法院在审理此类案件时，应当严格审查原告的诉讼动机和证据，确保诉讼的公正性和效率。同时，被告也应当积极采取措施，保护自己的合法权益不受侵害。